Flapjack نرم افزاری برای مشاهده گرافیکی داده های ژنوتیپی و هاپلوتیپی است که می تواند داده هایی با حجم بالا (مانند داده های NGS) را نیز مدیریت کند. استفاده از این ابزار آنالیز این نوع داده ها را تسهیل می سازد. این نرم افزار امکان مقایسه بین مارکرها، لاین ها و کروموزوم ها را به صورت گرافیکی فراهم می کند. ورودی این نرم افزار داده های نقشه، ژنوتیپی و صفات ارزیابی شده است. از جمله ویژگی های مهم این نرم افزار می توان به موارد زیر اشاره کرد:
نمایش گرافیکی ژنوتیپ ها و آلل های آن ها با رنگ های مختلف با توجه به حالت، فراوانی یا تشابه
نمایش حذفیات (deletions) و درجیات (insertions) داده ها
مرتب کردن و گروه بندی لاین ها با توجه به تشابه ژنوتیپی آن ها با دیگر لاین ها
همترازی داده های نقشه (مانند مکان های QTL) با ژنوتیپ ها برای شناسایی هاپلوتیپ های مرتبط
و ...
این نرم افزار را میتوانید بصورت رایگان از لینک زیر دانلود نمایید:
نوشتن دیدگاه